Otro rincón que merece visitarse en Colonia es la mítica Iglesia Matriz, en la sombreada Plaza de Armas. Esta iglesia, que comenzó a construirse en 1680, es la más antigua de Uruguay, aunque ha sido completamente reconstruida en dos ocasiones. En la misma plaza donde se encuentra la iglesia se conservan los cimientos de una casa de la época de los colonos portugueses.
Una igleasia encalada mucho más interesante en su exterior y por sus alrededores que por su interior, que no revierte un especial interés.